Tel.: +420 585 634 801 Mail: botany@upol.cz
Katedra botaniky
Pro studenty
Kontakt
Tel.: +420 585 634 801
Mail: botany@upol.cz

Celý kontakt   Celý kontakt
Přírodovědecká fakulta UPOL

Ing. Petr Smýkal, Ph.D.

Osobní informace

  * 1969, Zlín
mail to Petr Smýkal petr.smykal@upol.cz
  Tel.: 585 634 827

Vzdělání

  • 1984 - 1988 Gymnasium, Krnov
  • 1988 - 1994 Vysoká škola zemědělská, Agronomická fakulta, Přírodovědecká fakulta, Universita Karlova Praha, meziobor: rostlinné biotechnologie (Ing.)
  • 1994 - 1999 Doktorandské studium (Dr. PhD.) Obor molekulární biologie rostlin– Katedra anatomie a fysiologie rostlin, Přírodovědecká fakulta, Universita Karlova, Praha

Praxe

  • 1993 - 94 technický pracovník, Laboratoř rostlinných explantátů, Vysoká škola zemědělská, Praha
  • 1994 - 97 asistent, Katedra fysiologie a anatomie rostlin, PřF UK Praha
  • 1997 - 99 odborný asistent , Katedra fysiologie a anatomie rostlin, PřF UK Praha
  • 1999 - 2001 ETH, Swiss Federal Institute of Technology, Zūrich, Plant Genetics, Research Assistent – Modulation of flowering time in tobacco
  • 2001- 2003, Albrecht Ludwig University of Freiburg, Institute of Biologie III, Germany, Research Assistent – Role of ZWILLE gene in Arabidopsis meristem patterning
  • 2004 - 2011, Agritec Plant Research Šumperk s.r.o., Odd. biotechnologií, vědecký pracovník
  • 2011 (září) - Univerzita Palackého, PřF, katedra botaniky- odborný asistent

Pedagogická činnost

  • 1995-1999 MB130C14: Praktikum z fysiologie rostlin. Katedra fysiologie a anatomie rostlin. PřF UK Praha. podíl 30% (interní pedagog)
  • 2006-dosud KBE/APLGE: Aplikovaná genetika. Katedra biologie a ekologie, PřF, Ostravská universita. podíl 20% (externí pedagog)
  • 2008-dosud GEDI: Genetická diverzita. Ústav biologie rostlin, MENDELU Brno, podíl 10% (externí pedagog)
  • 2008-dosud MB130P19I: Biotechnologie a genové inženýrství rostlin. Katedra experimentální biologie rostlin, PřF UK. podíl 10% (externí pedagog)
  • 2010-dosud MB130P77: Rostliny a rozkvět a pád civilizace. Katedra experimentální biologie rostlin, PřF UK. podíl 20% (externí pedagog)
  • 2011: Molekulární markery ve šlechtění rostlin, MMSR, PřF UPOL, 50%
  • 2011: Ochrana fytogenofondu OFGSB, PřF UPOL, 20%
  • 2012: Proměnlivost a evoluce rostlin BOT/PVRSB, PřF UPOL, 100%
  • 2012: Šlechtění rostlin BOT/SRO, 50%

Významné zahraniční stáže

  • 1992-93 JET TEMPUS, University of Cordoba, Spain, Microspore embryogenesis of cereals
  • JET TEMPUS, Cambridge Science Park, Biogemma - Nickerson Seed Ltd, UK
  • 1996 University of Nijmegen, Netherlands. Molecular and Cellular Aspects of Plant Reproduction
  • 2005 University of Dundee at SCRI, A.Flavell laboratory
  • 2006 OECD fellowship, A.Schulman, Genome Dynamics Laboratory, University of Helsinki
  • 2008 Royal Society of Edinburgh fellowship, University of Dundee at SCRI
  • 2012 Royal Society of Edinburgh fellowship, Royal Botanic Garden Ediburgh, fylogeneze Vicieae

Členství ve vědeckých společnostech, radách, komisích a redakčních radách časopisů

  • European Federation of Plant Physiologist (FESPP)
  • Česká společnost experimentální biologie rostlin (ČSEBR)
  • EUCARPIA
  • GL-TTP (EU Grain Legumes -Technology Tranfer Platform ), president (2008-2010)
  • Czech Journal of Genetics and Plant Breeding (ISSN 1212-1975)
  • Grain Legume Magazine

Výzkumné zaměření

Studium genetické diverzity a fylogeneze Vicieae s důrazem na rody Pisum a Vavilovia
Studium evoluce a dometikace rostlin, genetické mechanismy domestikačního procesu
Mapování genů podmiňujících domestikační znaky na modelu hrachu (dormance semen, pukavost lusků)
Využití planých příbuzných rostlin k rozšíření genetické variability kulturních rostlin – introgresní a rekombinantí linie
Studium mechanismů rezistence hrachu k PSbMV viru, v kontextu ko-evoluce (patogenu a genu rezistence) v rámci zástupců podčeledi Vicieae

Vedoucí bakalářských prací

  • 2006-2007: Z. Dočkalová, Ostravská universita
  • 2006-2007: T. Dohnalová, Ostravská universita
  • 2011-2012: M. Chaloupská, Universita Palackého – Studium vnitrodruhové variability Vici tetrasperma, Lathyrus ochrus a L. clymenum
  • 2011-2012: Ž. Juračková, Universita Palackého - Dormance semen planých forem hrachu (Pisum sativum subsp. elatius) v kontextu domestikace kulturního hrachu
  • 2012: O.Trněný, MENDELU Brno
  • 2013: B. Míčová, UPOL
  • 2013: H. Štefanová, UPOL

Vedoucí magisterských prací

  • 2007-2009: Z. Dočkalová, Ostravská universita
  • 2006-2008: J. Cieslarová, MZLU Brno
  • 2009-2010: V. Hudzieczek, Mendelu Brno – Analýza genu rezistence hrachu k PSbMV viru
  • 2009-2010: E. Konečná, MENDELU Brno
  • 2013: L. Smutná, MENDELU Brno
  • 2013: M. Chaloupská, UPOL (2013 -)

Vedoucí dizertačních prací

  • 2008-2011: J. Cieslarová, MENDELU Brno
  • 2007-2009: N. Kerteszová- Bačová, University of Nitra
  • 2010-2014: E. Konečná, MENDELU Brno

Přehled (spolu)řešených projektů

  • 1997-99: (Fysiologické a genetické mechanismy pylové embryogenese u rodu Brassica. COST- OC 822.60, MŠMT (odpovědný řešitel)
  • 1996-98: Pylové embryogenese u Brassica napus. Grantová agentura Univezity Karlovy (odpovědný řešitel)
  • 1996-98: Program "250" - "Posílení výzkumu na vysokých školách": Rostlinná buňka a stres. VS 96145. MŠMT (další spoluřešitel)
  • 1998-99: Regulace a signalizace v živých soustavách.Výzkumný záměr PřFUK, MSM 113100003 (další spoluřešitel)
  • 1999-2001: Transition on flowering in photoperiodic tobacco. National Science Foundation, Switzerland (odpovědný řešitel)
  • 2001-2004: Role of Zwille in meristem paterning of Arabidopsis. DGA, Germany (odpovědný řešitel)
  • 2003-2007: Tvorba transgenních linií hrachu (Pisum sativum L.) se zvýšenou odolností k virovým patogenům, QF3072, MZe (řešitel)
  • 2004: OC 843.70 Fyziologické a genetické aspekty somatické embryogeneze u hrachu (Pisum sativum L.). COST 843, MŠMT (spoluřešitel)
  • 2008-2010: Technology Transfer Platform for breeding and growing of Grain legumes. EU program GL-TTP. INGO projekt MŠMT (odpovědný řešitel, koordinátor)
  • 2004-2010: Studium a využití biotechnologických a molekulárních metod v geneticko-šlechtitelském výzkumu rodu Pisum a Linum.) Výzkumný záměr MSM2678424601, MŠMT (řešitel, administrator)
  • 2006-2011: Semeno lnu pro zdraví člověka. 2B06087 NPV II projekt, MŠMT. (řešitel)
  • 2006-2011: Funkční genomika a proteomika ve šlechtění rostlin. Výzkumné centrum 1M06030. MŠMT. (řešitel)
  • 2009-2013: Konvenční a molekulárně-genetické přístupy při tvorbě luskovin rezistentních vůči virovým a houbovým chorobám a hmyzím škůdcům. QI91A229 MZe. (řešitel)
  • 2010-2012: Perfect markers for resistance genes in pea (Pisum sativum L.) to Fusarium root rot and Fusarium wilt. MŠMT, KONTAKT project with USDA-ARS, Pullman (odpovědný řešitel)
  • 2010-2012: Construction of introgression lines carrying wild pea (Pisum fulvum/P. elatius) segments in cultivated pea (Pisum sativum L.): A tool for discovery of novel traits. MŠMT, KONTAKT project with Russian Academy of Sciences, Novosibirsk (odpovědný řešitel)
  • 2010-2011: Towards comprehensive pea germplasm management for future use. LOA 10/048, AEGIS, Bioversity International, Rome. (odpovědný řešitel, koordinátor)

Publikace

  • Konečná, E., Šafářová, D., Navrátil, M., Hanáček, P., Coyne, C., Flavell, A., Vishnyakova, M., Ambrose, M., Redden, R., Smýkal, P. (2014):Geographical Gradient of the eIF4E Alleles Conferring Resistance to Potyviruses in Pea (Pisum) Germplasm. - Plos One DOI: 10.1371/journal.pone.0090394[PDF]
  • Warkentin, T., Smýkal, P. , Coyne, C., Weeden, N., Domoney, C., Bing, D., Leonforte, T., Xuxiao, Z., Dixit, G.(2014):Pea. In: Grain Legumes, Handbook of Plant Breeding series. De Ron A. and Santalla M., Eds. Springer Science and Business Media.
  • Kwon, S. J., Smýkal, P. , Hu, J., Wang, M., Kim, S. J., McGee, R. J., McPhee, K., Coyne, C. J.(2013):User-friendly markers linked to Fusarium wilt race 1 resistance Fw gene for marker-assisted selection in pea. Plant Breeding 132, 642–648.
  • Mikić, A., Smýkal, P. , Kenicer, G., Vishnyakova, M., Sarukhanyan, N., Akopian, J., Vanyan, A., Gabrielyan, I., Smýkalová, I., Sherbakova, E.(2013):The bicentenary of the research on 'beautiful' vavilovia (Vavilovia formosa), a legume crop wild relative with taxonomic and agronomic potential. Botanical Journal of the Linnean Society 172 (4): 524-531.
  • Vrbová, M., Kotrba, P., Horacek, J., Smýkal, P. , Švábová, L., Větrovcová, M., Smýkalová, I., Griga, M.(2013):Enhanced accumulation of cadmium in Linum usitatissimum L. plants due to overproduction of metallothionein alpha-domain as a fusion to beta-glucuronidase protein. Plant Cell Tissue And Organ Culture 112(3): 321-330.
  • De Beukelaer, H., Smýkal, P. , Davenport, G. F., Fack, V.(2013):Core Hunter II: fast core subset selection based on multiple genetic diversity measures using Mixed Replica search. BMC Bioinformatics 13: 312
  • Smýkal, P. , Coyne, C., Redden, R., Maxted, N.(2013):Peas. In: Genetic and Genomic Resources of Grain Legume Improvement. Singh M. and Upadhyaya H., Eds. Elsevier, Netherlands.
  • Smýkal, P. , G. Aubert, J. Burstin, C.J. Coyne, N.T.H. Ellis, A.J. Flavell, R. Ford, M. Hýbl, J. Macas, a kol.(2012):Pea (Pisum sativum L.) in the Genomic Era. Review. Open Access Agronomy 2: 74- 115
  • Jing R., Ambrose M.A., Knox M.R., Smýkal, P. , Hybl M., Ramos Á., Caminero C., Burstin J., Duc G., a kol.(2012):Genetic Diversity in European Pisum Germplasm Collections. Theor Appl Genetics 125: 367-380
  • Cieslarová J., Hýbl M., Griga M., Fialová E., Smýkal, P. (2012):Molecular Analysis of Temporal Genetic Structuring in Pea (Pisum sativum L.) Cultivars Bred in the Czech Republic and in Former Czechoslovakia Since the Mid-20th Century. Czech J Genet Pl Breed 48: 61-73.
  • Smýkal, P. , Kenicer G., Flavell A.J., Corander J., Kosterin O., Redden R.J., Ford R., Coyne C.J., Maxted N., Ambrose M.J.(2011):Phylogeny, phylogeography and genetic diversity of the Pisum genus. Plant Genetic Resources 9: 4-18
  • Smýkal, P. , Bačová-Kerteszová, N., Kalendar, R., Corander, J., Schulman, A.H., Pavelek, M.(2011):Genetic diversity of cultivated flax (Linum usitatissimum L.) germplasm assessed by retrotransposon-based markers. Theor Appl Genetics 122: 1385 - 1397
  • Cieslarová, J., Smýkal, P. , Dočkalová, Z., Hanáček, P., Procházka, S., Hýbl, M., Griga, M.(2011):Molecular evidence of genetic diversity changes in pea (Pisum sativum L.) germplasm after long-term maintenance. Genet Resour Crop Evol. 58: 439-451
  • Smýkal, P. (2011):Molekulární detekce genu rezistence hrachu k viru mozaiky přenosné semenem (PSbMV) 2011.
  • Cieslarová J, Hanáček P., Fialová E., Hýbl M., Smýkal, P. (2011):Estimation of pea (Pisum sativum L.) microsatellite mutation rate based on pedigree and single-seed descent analyses. J Appl Genetics 52: 391-401
  • Upadhyaya HD, Dwivedi SL, Ambrose M, Ellis N, Berger J, Smýkal, P. , D. Debouck D, Duc G, Dumet D, Flavell A(2011):Legume genetic resources: management, diversity assessment, and utilization in crop improvement. Euphytica 180: 27-47
  • Cieslarová J., Hanáček P., Fialová E., Hýbl M., Smýkal, P. (2011):Estimation of pea (Pisum sativum L.) microsatellite mutation rate based on pedigree and single-seed descent analyses. J Appl Genetics 52: 391-401
  • Zorić, L., Mikić, A., Akopian, J., Sarukhanyan, N., Gabrielyan, I., Vanyan, A., Luković, J., Smýkal, P. , Kenicer, G., Vishnyakova M. at all.(2010):Contributions to the characterization of Vavilovia formosa (syn. Pisum formosum.). I. Anatomy of stem, leaf and calyx. Pisum Genetics 42: 21-24
  • Atlagić, J., Mikić, A., Sarukhanyan, N., Akopian, J., Vanyan, A., Gabrielyan, I., Smýkal, P. , Kenicer, G., Vishnyakova, M., Ambrose, M.(2010):Contributions to the characterization of Vavilovia formosa (syn. Pisum formosum). II. Morphology of androecium and gynoecium and mitosis. Pisum Genetics 42: 25-27
  • Zeremski-Škorić, T., Mikić, A., Sarukhanyan, N., Akopian, J., Vanyan, A., Gabrielyan, I., Smýkal, P. , Kenicer, G., Vishnyakova, M., Ambrose, M.(2010):Contributions to the characterization of Vavilovia formosa (syn. Pisum formosum). III. Contents of macro- and microelements. Pisum Genetics 42: 28-30
  • Kalendar, R., Antonius, K., Smýkal, P. , Schulman, A.(2010):A universal method for DNA fingerprinting and retrotransposon isolation. Theor Appl Genetics. 121:1419-30.
  • Jing, R., Vershinin, A., Grzebyta, J., Shaw, P., Smýkal, P. , Marshall, D., Ambrose, M.J., Ellis,T.H.N., Flavell, A.J.(2010):The genetic diversity and evolution of field pea (Pisum) studied by high throughput retrotransposon based insertion polymorphism (RBIP) marker analysis. BMC Evolutionary Biology 10: 44.
  • Mikič, A., Smýkal, P. , Kenicer, G., Sarukhanyan, N., Akopian, J., Gabrielyan, I., Vanyan, A., Sinjushin, A., Demidenko, N., Čupina, B. at all.(2010):Achievements in Research on Vavilovia (Vavilovia formosa (Stev.) Fed.), a Legume Crop Wild Relative. Field Veg. Crop Res. 47: 387-394.
  • Smýkal, P. , Šafářová, D., Navrátil, M., Dostalová, R.(2010):Marker assisted pea breeding: eIF4E allele specific markers to pea seed-borne mosaic virus (PSbMV) resistance. Mol Breeding, 26: 425-438.
  • Smýkal, P. (2010):Genetika a genomika v luskovinách. In: Houba - Hochman - Hosnedl a kol. (ed.) LUSKOVINY, pěstování a uţití. (ISBN 978-80-87111-19-2) 2010, p. 59-67 .
  • Akopian J., Sarukhanyan N., Gabrielyan I., Vanyan A., Mikić A., Smýkal, P. , Kenicer G., Vishnyakova M., Sinjushin A., Demidenko N.(2010):Reports on establishing an ex situ site for 'beautiful' vavilovia (Vavilovia formosa) in Armenia. Genet Resour Crop Evol. 57: 1127–1134
  • Horáček, J., Griga, M., Smýkal, P. , Hýbl, M.(2009):Effect of Environmental and Genetic Factors on the Stability of Pea (Pisum sativum L.) Isozyme and DNA Markers. Czech J. Genet. Plant Breed. 45: 57–71.
  • Smýkal, P. , Kalendar, R., Ford, R., Macas, J., Griga, M.(2009):Evolutionary conserved lineage of Angela-like retrotransposons as a genome-wide microsatellite repeat dispersal agent. Heredity 103: 157–167.
  • Mikič, A., Smýkal, P. , Kenicer, G., Vishnyakova, M., Sarukhanyan, N., Akopian, J., Gabrielyan, I., Vanyan, A., Čupina, B., Mihailovič V. at all.(2009):A revival of research on beautiful vavilovia (Vavilovia formosa syn. Pisum formosanum). Pisum Genetics 41: 11-14.
  • Vrbová, M., Horáček, J., Smýkal, P. , Griga, M.(2009):Flax (Linum usitatissimum L.) transformation with heavy metal binding protein genes. In: Sehnal F., Drobník J. (Eds.) White Book Of Genetically Modified Crops. EU regulations and research experience from the Czech Republic. Biology Centre AS CR České Budějovice (ISBN 978-80-86668-05-3) 2009, p. 57.
  • Švábová, L., Griga, M., Navrátil, M., Šafářová, D., Hanáček, P., Reinöhl, V., Horáček, J., Smýkal, P. (2009):Transgenic pea (Pisum sativum L.) lines with improved tolerance to Pea Enation Mosaic Virus and Pea Seed-borne Mosaic Virus. In: Sehnal F., Drobník J. (Eds.) White Book Of Genetically Modified Crops. EU regulations and research experience from the Czech Republic. Biology Centre AS CR České Budějovic
  • Smýkal, P. , Hýbl, M., Corander, J., Jarkovský, J., Flavell, A., Griga, M.(2008):Genetic diversity and population structure of pea (Pisum sativum L.) varieties derived from combined retrotransposon, microsatellite and morphological marker analysis. Theor Appl Genetics 117: 413-424.
  • Smýkal, P. , Coyne, C.J., Ford, R., Redden, R., Flavell, A.J., Hýbl, M., Warkentin, T., Burstin, J., Duc, G., Ambrose, M. at all.(2008):Effort towards a world pea (Pisum sativum L.) germplasm core collection: The case for common markers and data compatibility. Pisum Genetics 40: 11-14.
  • Smýkal, P. , Horáček, J., Dostálová, R., Hýbl, M.(2008):Variety discrimination in pea (Pisum sativum L.) by molecular, biochemical and morphological markers. J Appl Genetic 49: 155-166.
  • Švábová, L., Smýkal, P. , Griga, M.(2008):Agrobacterium-mediated transformation of pea (Pisum sativum L.): Transformant production in vitro and by non-tissue culture approach. In: M. C. Kharkwal (ed.), Food Legumes for Nutritional Security and Sustainable Agriculture, New Delhi, India, p.208-220 (ISBN 978-81-908995-2-9).
  • Smýkal, P. , Valledor, L., Rodríguez, R., Griga, M.(2007):Assessment of genetic and epigenetic stability in long-term in vitro shoot culture of pea (Pisum sativum L.). Plant Cell Rep. 26: 1985-98.
  • Smýkal, P. , Gennen, J., De Bodt, S., Ranganath, V., Melzer, S.(2007):Flowering of strict photoperiodic Nicotiana varieties in non-inductive conditions by transgenic approaches.Plant Mol Biol. 65: 233-42.
  • Smýkal, P. (2006):Development of an efficient retrotransposon-based fingerprinting method for rapid pea variety identification. J Appl Genetic 47: 221–230.
  • Švábová, L., Smýkal, P. , Griga, M., Ondřej, V. (2005):Agrobacterium-mediated transformation of Pisum sativum in vitro and in vivo. Biol. Plant. 49(3), 361-370.
  • Švábová, L., Smýkal, P. , Griga, M., Ondřej, V. (2005):Agrobacterium-mediated transformation of Pisum sativum by in vitro and in vivo approach. Biologia Plantarum 49: 361-370.
  • Smýkal, P. , Gleissner, R., Corbesier, L., Apel, K., Melzer, S.(2004):Modulation of flowering responses in different Nicotiana varieties. Plant Molecular Biology 55: 253-262.
  • Pechan, P.M., Smýkal, P. (2001):Androgenesis: affecting the fate of the male gametophyte. Physiologia Plantarum, 111, 1- 8.
  • Fidlerová, A., Smýkal, P. , Tupý, J., Čapková, V.(2001):Glycoproteins 66 and 69 kDa of pollen tube wall: properties and distribution in angiosperms. J.Pl.Physiology 158: 1367-1374.
  • Chandler, J., Smýkal, P. , Melzer, S.(2001):FPF1 and flowering time control via GA signalling. Flowering Newsletter 31: 19-24.
  • Smýkal, P. (2001):Pollen embryogenesis - the stress mediated switch from gametophytic to sporophytic development. Current status and future prospects. Review. Biologia Plantarum 43, 481-489.
  • Chandler, J., Smýkal, P. , Melzer, S.(2001):Recent Research Developments in Plant Physiology, Vol. 2 In.: S.G.Pandalai (ed.), The transition to flowering, (ISBN:81-7736-046-9) 2001, p. 259-269.
  • Smýkal, P. , Pechan, P.M.(2000):Stress, as assessed by the appearance of sHsp transcripts, is required but not sufficient to initiate androgenesis. Physiologia Plantarum 110, 135-144.
  • Smýkal, P. , Mašín, J., Hrdý, I., Konopásek, I., Ţárský, V.(2000):Chaperone activity of tobacco HSP18, a small heat-shock protein, is inhibited by ATP. Plant J. 23, 703-713.
  • Rosel, D., Puta, F., Blahušková, A., Smýkal, P. , Folk, P.(2000):Molecular characterization of a calmodulin-like Dictyostelium protein CalB. FEBS Lett. 473, 323-327.
  • Smýkal, P. , Hrdý, I., Pechan, P.M.(2000):High-molecular-mass complexes formed in vivo contain smHSPs and HSP70 and display chaperone-like activity. Eur J Biochem. 267, 2195-207.
  • Smýkal, P. , Janotová, I., Pechan, P.M.(2000):A novel Brassica napus L. pollen-specific gene belongs to a nucleic-acid-binding protein family. Sex Plant Reprod. . 13, 127-134, 2000.
  • Mašek, T., Smýkal, P. , Janotová, I., Honys,D., Čapková,V., Pechan, P.(2000):Isolation of a Brassica napus L. cDNA encoding a putative high-mobility-group MHG I/Y protein. Plant Science 159, 197 – 204.
Izon favicon Copyright © Katedra botaniky Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého, IZON s.r.o., 2011 - 2014
RSS  RSS  |   Mapa stránek  |   Kontakt